神奈川県警の横溝重悟刑事の初登場回でもあります。
836-837話 仲の悪いガールズバンド 88巻File10～89巻File1 登場なし。
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コナンも火傷赤井のことを見つけて追いかけますが見失います。 コナンは偶然、水無怜奈さんの靴に付いた発信機から七つの子の音が聞こえてきて、水無怜奈さんが黒の組織と関わりのある人物と分かりました。
8ジョディ先生が赤井さんが缶コーヒーを床に落としたことをとある男に話しますが、最後にその男が安室さんの変装であることが分かります。 赤井秀一の登場回 アニメ・漫画 ：「シカゴから来た男」 ミスでさらわれてしまうジェームズ・ブラックを赤井秀一が追跡していきました。
宮野明美に対する赤井秀一の心境 明美と関わった 赤井の心境はジェイムズやジョディの発言から伺えます。
FBIと黒の組織の決着は衝撃的な展開で幕を下ろします。
事件中、赤井と世良の関係が言及されます。
843-844話 探偵団はヤブの中 89巻File2～4 コナンの回想で登場。 切ないですね。 毛利蘭は、赤井秀一といっしょにいた人物がFBIのジャンパーを着ていたと思い出します。
【シーズン6】230,231：謎めいた乗客（前編、後編）• 来葉峠での赤井の「まさかここまでとはな…」という発言から、この計画を企てた協力者がいて、その協力者はコナンだと指摘します。 火傷赤井秀一：登場回 15シーズン 65巻• この時、作中では赤井秀一は死亡しているということになっており、沖矢昴の姿として登場。
赤井らしき男は拳銃を発砲し、銀行強盗からコナンを助けて姿を消しました。
園子や蘭と一緒に、コナンと沖矢もリハーサル見学に行くことになった。
世界各地から、有名なスポンサーが集まっているパーティ会場で、 突如企業の重鎮が相次いで拉致されるという事件が発生。
作中でふたりが姉妹だというはっきりとした根拠があるわけではありませんが、インタビューで「とあるふたりの母同士が姉妹」とあったことからそのような噂になっているようです。
19861-862話 17年前と同じ現場（89巻File11～90巻File2） 沖矢昴として登場。 ジョディに近づいた変装中のバーボンは、赤井が死んでいないということに気づき始めます。
次は、世良真純と同母兄弟である赤井秀一の父親は誰なのかというもの。
赤井秀一 沖矢昴 の登場回 アニメ・漫画 ：「推理対決！新一vs沖矢昴」 この回では、文字通り、工藤新一と沖矢昴による推理合戦が展開されていきました。
しかし、この来葉峠の出来事こそコナン史上最大の伏線であり、その解明には7年近い時間がかかっています。
【赤井さんの出番は？】 783話終盤のシーンがもう一度流されるだけです。
258ー259話 シカゴから来た男 とあるきっかけからジェイムズ・ブラックと知り合った少年探偵団だったが、ジェイムズが人違いでさらわれてしまう。
ジェイムズ「どうも恋人を亡くしてからの彼は心を閉ざす傾向にあるようだ…それ以前も開いていたわけではないがね…」 ・ブラックインパクト！組織の手が届く瞬間（アニメ425話／48-49巻）• 972話、973話、974話にチラリと登場！ おわりに まとめてみると、他のキャラクターが赤井さんを思い浮かべたときにチラリと登場することが多くて、出番はあんまりありませんね・・・（＾＾；） がっつり活躍するときは物語も進展する重要回ばかり。
さらにその現場にいた組織の一員・カルバドスも拳銃自殺。
赤井秀一の登場回 アニメ・漫画 ：「赤と黒のクラッシュ」 赤井秀一が自らの過去を回想していきます。 特に人気の高いシーンは、まずバーボンとキールが黒の組織にNOCではないかという疑いがかけられてしまい、拘束されて尋問を受けているシーン。
253-254話 本庁の刑事恋物語４ 32巻File11～33巻File2 佐藤刑事のお見合い話を聞きつけ、蘭と園子が彼女の見合い会場へ。
そのバスに赤井さんやジョディ先生、新出先生も乗り合わせます。
ですが、おなじくスコッチを助けようと階段を駆け上がってきた安室の足音に気を取られ、拳銃を奪われてしまいます。
17年前 父務武が消息不明に 死亡とされているが、遺体は見つかっていない 92 アメリカに留学 父の事件の真相を探るためにアメリカに留学 92 10年前 工藤新一と初対面 赤井秀一とその母弟妹が工藤新一と毛利蘭に出会う 92 5年前 組織に潜入 諸星大として宮野明美と出会う 組織に潜入し、ライのコードネームが与えられる 58 4年前 スコッチの自殺に遭遇 安室との間に確執が生まれる 90 2年前 組織から離脱 FBIのジン捕獲作戦が失敗し、組織から離脱 58 1年前 蘭に再開 ニューヨークで高校生となった蘭に出会う 35 現在 明美からメールが来る 明美から「組織から抜けられた今度は本当の彼氏から付き合ってくれますか? 307-308話 残された声なき証言 37巻File5～7 事件解決後、毛利探偵事務所へ帰るコナンと蘭は、電話ボックスから出てきた赤井秀一と会います。 ジョディは今も赤井に未練がある様子です。
866-867話 裏切りのステージ 90巻File6～9 ロックミュージシャンの波土禄道の新曲「ASACA」が17年前に作ったものだということを知り、コナン、蘭、園子と一緒に沖矢昴としてリハーサル見学に行きます。
しかし明美はメールを送った後、組織を抜ける為に与えられた仕事の途中で殺されてしまいました。
出典：名探偵コナン映画「純黒の悪夢」より あのヘリコプターを撃ち落とす時に 「堕ちろ」というセリフは、多くのファンを魅了。
【シーズン20】792,793：三人の第一発見者（前編、後編）• 海に来ていた赤井たちは、とあるきっかけでコナン・蘭と知り合い談笑していた時に事件は起きた。